MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. CCGE1003 chromosome 1

Total Repeats: 104306

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014539	CG	3	6	6	11	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014539	ATC	2	6	12	17	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014539	GCC	2	6	113	118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014539	GC	4	8	120	127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014539	TGC	2	6	132	137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014539	ATG	2	6	214	219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014539	CGC	2	6	222	227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_014539	GCT	2	6	286	291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014539	TTG	2	6	299	304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014539	GC	3	6	308	313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014539	GCG	2	6	324	329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014539	TGA	2	6	360	365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728077
13	NC_014539	CAG	2	6	416	421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728077
14	NC_014539	ACGTG	2	10	423	432	20 %	20 %	40 %	20 %	307728077
15	NC_014539	CGC	2	6	463	468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728077
16	NC_014539	GC	4	8	616	623	0 %	0 %	50 %	50 %	307728077
17	NC_014539	GCG	2	6	632	637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
18	NC_014539	GC	4	8	647	654	0 %	0 %	50 %	50 %	307728077
19	NC_014539	CGG	2	6	685	690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
20	NC_014539	GCGG	2	8	698	705	0 %	0 %	75 %	25 %	307728077
21	NC_014539	CGG	2	6	721	726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
22	NC_014539	CGC	2	6	730	735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728077
23	NC_014539	CGC	2	6	742	747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728077
24	NC_014539	GGC	2	6	763	768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
25	NC_014539	CG	4	8	775	782	0 %	0 %	50 %	50 %	307728077
26	NC_014539	GC	4	8	815	822	0 %	0 %	50 %	50 %	307728077
27	NC_014539	GCC	2	6	824	829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728077
28	NC_014539	CGAA	2	8	867	874	50 %	0 %	25 %	25 %	307728077
29	NC_014539	CGG	2	6	879	884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
30	NC_014539	CGC	2	6	887	892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728077
31	NC_014539	GC	4	8	1019	1026	0 %	0 %	50 %	50 %	307728077
32	NC_014539	CGG	2	6	1084	1089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
33	NC_014539	GC	3	6	1155	1160	0 %	0 %	50 %	50 %	307728077
34	NC_014539	GTG	2	6	1199	1204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728077
35	NC_014539	CGA	2	6	1228	1233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728077
36	NC_014539	CTA	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728077
37	NC_014539	CTG	3	9	1262	1270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728077
38	NC_014539	CGA	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728077
39	NC_014539	TCA	3	9	1362	1370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728077
40	NC_014539	CGA	2	6	1405	1410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728077
41	NC_014539	GCC	2	6	1456	1461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728077
42	NC_014539	TGAA	2	8	1521	1528	50 %	25 %	25 %	0 %	307728077
43	NC_014539	TCG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728077
44	NC_014539	GC	3	6	1584	1589	0 %	0 %	50 %	50 %	307728077
45	NC_014539	AAG	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728077
46	NC_014539	CTG	2	6	1667	1672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728077
47	NC_014539	AGA	2	6	1710	1715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728077
48	NC_014539	GAA	2	6	1759	1764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728077
49	NC_014539	CGG	2	6	1858	1863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
50	NC_014539	ACCAC	2	10	1869	1878	40 %	0 %	0 %	60 %	307728077
51	NC_014539	TGC	2	6	1881	1886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728077
52	NC_014539	CGA	2	6	1906	1911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728077
53	NC_014539	GCA	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728077
54	NC_014539	GCG	2	6	1976	1981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014539	AAC	2	6	1992	1997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014539	GGT	2	6	2032	2037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014539	CGG	2	6	2120	2125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014539	GC	3	6	2168	2173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014539	CCT	2	6	2230	2235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307728078
60	NC_014539	CGC	2	6	2270	2275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728078
61	NC_014539	CAC	2	6	2362	2367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307728078
62	NC_014539	GC	3	6	2368	2373	0 %	0 %	50 %	50 %	307728078
63	NC_014539	GCG	2	6	2388	2393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728078
64	NC_014539	CTC	2	6	2426	2431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307728078
65	NC_014539	GC	3	6	2440	2445	0 %	0 %	50 %	50 %	307728078
66	NC_014539	TCACGC	2	12	2463	2474	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	307728078
67	NC_014539	CGC	2	6	2533	2538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728078
68	NC_014539	CAG	2	6	2645	2650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728078
69	NC_014539	CTA	2	6	2659	2664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728078
70	NC_014539	TGC	2	6	2676	2681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728078
71	NC_014539	GTG	2	6	2684	2689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728078
72	NC_014539	TCG	2	6	2741	2746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728078
73	NC_014539	CG	3	6	2767	2772	0 %	0 %	50 %	50 %	307728078
74	NC_014539	CGA	2	6	2833	2838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728078
75	NC_014539	TGG	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728078
76	NC_014539	GAA	2	6	2984	2989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728078
77	NC_014539	CG	3	6	3008	3013	0 %	0 %	50 %	50 %	307728078
78	NC_014539	GAA	2	6	3113	3118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728078
79	NC_014539	ACG	2	6	3132	3137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728078
80	NC_014539	TGC	2	6	3207	3212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728078
81	NC_014539	ACG	2	6	3264	3269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728078
82	NC_014539	GTG	2	6	3281	3286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728078
83	NC_014539	AC	3	6	3322	3327	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014539	AGC	2	6	3379	3384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014539	CAG	2	6	3389	3394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014539	A	6	6	3409	3414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014539	ACA	2	6	3446	3451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307728079
88	NC_014539	CAC	2	6	3550	3555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307728079
89	NC_014539	GAC	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
90	NC_014539	AGCGC	2	10	3713	3722	20 %	0 %	40 %	40 %	307728079
91	NC_014539	CGG	2	6	3753	3758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
92	NC_014539	GGC	2	6	3790	3795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
93	NC_014539	GGCGTG	2	12	3802	3813	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	307728079
94	NC_014539	CGTG	2	8	3815	3822	0 %	25 %	50 %	25 %	307728079
95	NC_014539	AAG	2	6	3868	3873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728079
96	NC_014539	TGA	2	6	3935	3940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728079
97	NC_014539	CGA	2	6	4002	4007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
98	NC_014539	GAA	2	6	4123	4128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728079
99	NC_014539	CGG	2	6	4143	4148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
100	NC_014539	CAA	2	6	4173	4178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307728079
101	NC_014539	TGC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728079
102	NC_014539	GGCGTG	2	12	4231	4242	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	307728079
103	NC_014539	GTGCT	2	10	4282	4291	0 %	40 %	40 %	20 %	307728079
104	NC_014539	AAC	2	6	4297	4302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307728079
105	NC_014539	CGG	2	6	4317	4322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
106	NC_014539	GC	3	6	4341	4346	0 %	0 %	50 %	50 %	307728079
107	NC_014539	CG	3	6	4355	4360	0 %	0 %	50 %	50 %	307728079
108	NC_014539	CGA	2	6	4422	4427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
109	NC_014539	CGTG	2	8	4445	4452	0 %	25 %	50 %	25 %	307728079
110	NC_014539	GC	4	8	4521	4528	0 %	0 %	50 %	50 %	307728079
111	NC_014539	GAA	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728079
112	NC_014539	GTG	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728079
113	NC_014539	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
114	NC_014539	GCA	2	6	4601	4606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
115	NC_014539	GC	5	10	4621	4630	0 %	0 %	50 %	50 %	307728079
116	NC_014539	GACGC	2	10	4659	4668	20 %	0 %	40 %	40 %	307728079
117	NC_014539	TCG	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728079
118	NC_014539	GGC	2	6	4771	4776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
119	NC_014539	GCT	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728079
120	NC_014539	GAC	2	6	4927	4932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
121	NC_014539	CAT	4	12	4962	4973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728079
122	NC_014539	GC	3	6	4994	4999	0 %	0 %	50 %	50 %	307728079
123	NC_014539	GCT	3	9	5010	5018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728079
124	NC_014539	GAT	2	6	5046	5051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728079
125	NC_014539	GCC	2	6	5079	5084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728079
126	NC_014539	TGC	2	6	5183	5188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728079
127	NC_014539	GC	4	8	5236	5243	0 %	0 %	50 %	50 %	307728079
128	NC_014539	CTG	2	6	5248	5253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728079
129	NC_014539	GGT	2	6	5262	5267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728079
130	NC_014539	GCC	2	6	5279	5284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728079
131	NC_014539	ACG	2	6	5288	5293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
132	NC_014539	GC	3	6	5297	5302	0 %	0 %	50 %	50 %	307728079
133	NC_014539	GGC	3	9	5346	5354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
134	NC_014539	GAAGC	2	10	5377	5386	40 %	0 %	40 %	20 %	307728079
135	NC_014539	GC	3	6	5467	5472	0 %	0 %	50 %	50 %	307728079
136	NC_014539	CGA	2	6	5505	5510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
137	NC_014539	GCG	2	6	5582	5587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
138	NC_014539	GCG	2	6	5600	5605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
139	NC_014539	GCA	2	6	5609	5614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
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142	NC_014539	AGC	2	6	5717	5722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
143	NC_014539	GAC	2	6	5730	5735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
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147	NC_014539	TAGT	2	8	5915	5922	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014539	A	6	6	5967	5972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014539	CGG	2	6	5987	5992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014539	AGT	2	6	5995	6000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014539	GCC	2	6	6001	6006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_014539	TGA	2	6	6039	6044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014539	A	6	6	6063	6068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014539	GAGT	2	8	6112	6119	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014539	GCA	2	6	6124	6129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_014539	GCG	3	9	6131	6139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_014539	CGT	2	6	6230	6235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728080
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231	NC_014539	CGG	2	6	10602	10607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728083
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234	NC_014539	ATA	2	6	10804	10809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307728083
235	NC_014539	GAT	2	6	11114	11119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728084
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237	NC_014539	CAG	2	6	11337	11342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
238	NC_014539	GCC	2	6	11387	11392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728085
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241	NC_014539	CGC	2	6	11532	11537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728085
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247	NC_014539	GAAC	2	8	11775	11782	50 %	0 %	25 %	25 %	307728085
248	NC_014539	T	7	7	11798	11804	0 %	100 %	0 %	0 %	307728085
249	NC_014539	AG	3	6	11860	11865	50 %	0 %	50 %	0 %	307728085
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251	NC_014539	GCC	2	6	12046	12051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728085
252	NC_014539	GCGCA	2	10	12122	12131	20 %	0 %	40 %	40 %	307728086
253	NC_014539	CAG	2	6	12161	12166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728086
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255	NC_014539	CAG	2	6	12263	12268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728086
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258	NC_014539	TGA	2	6	12481	12486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728086
259	NC_014539	TCA	2	6	12517	12522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728086
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261	NC_014539	GCA	2	6	12682	12687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728086
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265	NC_014539	CGC	2	6	12922	12927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728086
266	NC_014539	TGA	2	6	13014	13019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728086
267	NC_014539	TCT	2	6	13044	13049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307728086
268	NC_014539	GAT	2	6	13173	13178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728087
269	NC_014539	GTTT	2	8	13236	13243	0 %	75 %	25 %	0 %	307728087
270	NC_014539	GAT	2	6	13261	13266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728087
271	NC_014539	CTG	2	6	13278	13283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728087
272	NC_014539	TCG	2	6	13322	13327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728087
273	NC_014539	CAGC	2	8	13482	13489	25 %	0 %	25 %	50 %	307728087
274	NC_014539	GTA	2	6	13594	13599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728087
275	NC_014539	GTA	2	6	13627	13632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728087
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277	NC_014539	GTGC	2	8	13779	13786	0 %	25 %	50 %	25 %	307728087
278	NC_014539	TGA	2	6	13797	13802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728087
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289	NC_014539	TGCC	2	8	14693	14700	0 %	25 %	25 %	50 %	307728088
290	NC_014539	CGT	2	6	14719	14724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728088
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393	NC_014539	GTT	2	6	20590	20595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307728094
394	NC_014539	CGA	2	6	20648	20653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728094
395	NC_014539	CTC	2	6	20718	20723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307728094
396	NC_014539	TTG	2	6	20743	20748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307728094
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398	NC_014539	GCA	2	6	20790	20795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728094
399	NC_014539	GTC	2	6	20878	20883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728094
400	NC_014539	TGG	2	6	20885	20890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728094
401	NC_014539	CG	3	6	20897	20902	0 %	0 %	50 %	50 %	307728094
402	NC_014539	CGG	2	6	20938	20943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728094
403	NC_014539	CGT	2	6	21012	21017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728094
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415	NC_014539	GCGG	2	8	21704	21711	0 %	0 %	75 %	25 %	307728095
416	NC_014539	GCG	2	6	21781	21786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728095
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429	NC_014539	GAT	2	6	22683	22688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728095
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431	NC_014539	CG	3	6	22806	22811	0 %	0 %	50 %	50 %	307728095
432	NC_014539	GCG	2	6	22922	22927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728095
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440	NC_014539	AC	3	6	23381	23386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
441	NC_014539	TGT	2	6	23398	23403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_014539	GC	3	6	23922	23927	0 %	0 %	50 %	50 %	307728096
453	NC_014539	GCGCA	2	10	23996	24005	20 %	0 %	40 %	40 %	307728096
454	NC_014539	ACT	2	6	24012	24017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728096
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463	NC_014539	CGT	2	6	24939	24944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
464	NC_014539	GCA	2	6	25051	25056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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470	NC_014539	CGG	2	6	25359	25364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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472	NC_014539	CAG	2	6	25469	25474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728098
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482	NC_014539	CCGG	2	8	26117	26124	0 %	0 %	50 %	50 %	307728098
483	NC_014539	CG	3	6	26141	26146	0 %	0 %	50 %	50 %	307728098
484	NC_014539	CGT	2	6	26175	26180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728098
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